Nel 2015 l’umanità è sull’orlo del Third Impact e l’ultimo baluardo è nel cuore dell’Agenzia Speciale Nerv.
Finora tutto è andato secondo i piani di G, ma nemmeno lui può prevedere quale ruolo giocherà suo figlio Shinji nello scontro finale. Si sta compiendo l’Apocalisse oppure un nuova rinascita attende la Terra?